守护神殿是元气骑士中一种充满挑战的防守模式，你的核心任务是保护大殿中央的魔法石，抵御源源不断从森林、冰川、火山三个方向传送门涌来的敌人。这个模式共有80波进攻，怪物会波次提升而越来越强，单凭个人力量难以坚守，因此需要巧妙利用地形、建造炮台并深入怪物据点探索以获得资源。游戏场景主要分为大殿、后殿及广阔的怪物据点，在后殿你可以找到各类NPC获得炮台、武器升级和属性强化等关键支援，合理的战略布局是通关的基石。
在开始挑战前，角色与武器的选择至关重要。牧师因其一技能可以为炮台恢复血量，能有效节省前期维修费用，被广泛推荐使用。武器方面，可以在大厅提前打造，天堂之拳被认为是度过炮台未成型前期的利器，它能有效抵挡怪物压力。其他表现突出的武器还包括雪狐玫瑰金和电弧手里剑，它们在清怪效率上各有优势。为这些武器搭配正确的天赋能极大增强威力，例如天堂之拳需要蓄力加快和散弹增多，而雪狐玫瑰金则依赖散弹增加、连击次数增多、暴击穿透和子弹反弹等属性。
炮台防御系统是本模式的核心玩法，你需要从后殿的机械大师处购买并部署它们。炮台种类多样，包括基础的攻击炮台以及护盾塔、天气控制器、充能装置、空军基地等具有特殊功能的类型。炮台可以升级星级以提升数值，并通过购买相同炮台来进阶品质，最高可升至18级。合理的炮台布局非常关键，例如将机枪塔置于左侧高位以避免火山怪物的集中火力，将护罩装置放置在上方保护关键路径，而地刺则适合放在底层阻挡敌人前进。切记，炮台受到攻击会损耗耐久，需要及时维修或更换。
掌握正确的流程打法能让你事半功倍。开局后，优先探索怪物据点以解救被困的工程师等NPC，并获取初始资源。战斗中，要确保主要武器如天堂之拳波次提升等级，角色自身等级也需跟进以节省升级武器的开销。防御上，炮台应尽早升至30级以上，并注意装备控制类武器。资源管理上，每波开始前刷新的补给箱记得拾取，星币则优先用于升级关键炮台和开采地图上的金矿。无需频繁检查全局，每20-30波进行一次防御巩固即可，同时利用与魔法石对话的功能可以提前开启下一波攻击，加快节奏。
针对关卡攻略，地图上的房间分为不同强度，其中中间带有笼子的房间关押着重要人员，应优先清理以解锁功能。有一种高效的据点清理顺序可供参考：首先解救三个区域笼中人员，随后依次攻克雪地、森林和火山区域的感叹号标记房间及周边据点，最终清理完所有区域。这样做的节奏能与怪物进攻波次自然衔接。在探索中，你会遇到拥有各种变异效果的怪物，例如神圣状态免伤、盾牌格挡远程子弹等，需要根据其弱点调整攻击方式，例如用近战武器直接攻击盾牌怪物本体。
面对最终的挑战，第80波左右的敌人强度极高，弹幕密集，此时可以合理运用游戏机制。通过在下波怪物出现时退出重进，可以实现跳关，快速接近最终关卡，但无法跳过终极首领外星母舰。母舰战分为两个阶段，第一阶段需集中火力摧毁其四个炮台，第二阶段则直接攻击本体核心。战斗时迅速移动至左下角进行输出，并密切观察其激光炮、追踪激光和全屏护盾扩散等攻击模式以灵活躲避。在守护神殿模式中击败特定的气宗NPC，还能完成成就并解锁该隐藏角色。
